שם משמואל - על חמישה חומשי תורה ועל המועדים. ספר זה הינו אמרותיו החסידיות שנאמרו מידי שבת בעת עריכת ה"טיש", ובהזדמנויות נוספות, ונכתבו על ידו מאוחר יותר

הספרים "שם משמואל"  נדפסו לראשונה בפולין מיד לאחר פטירתו, על ידי בנו בעל "חסדי דוד" בתשעה כרכים, (ב"כ בראשית, ב"כ שמות, ויקרא, במדבר, דברים, מועדים, הגדה של פסח). לאחר מכן בנו רבי חנוך בורנשטיין הדפיס את הספר בארץ ישראל במהדורה חדשה, ובאותיות מרובעות, וכיום הוא מודפסים ספרי ה"שם משמואל"  בששה כרכים בראשית, שמות, ויקרא, במדבר, דברים ומועדים, הגדה של פסח

חלק גדול מהספר מבוסס על תורת אביו בעל האבני נזר, כשהוא מצטט את דברים ומבארם

תפוצתו של ספר שם משמואל  הינו רבה ביותר בין בקהילה החרדית ובין בקהילה הדתית-לאומית, ורבים הם שיעורי התורה הקבועים בספר זה. הוא כתב גם את החלק הפנימי - הקצר - בספרו של אביו, "אגלי טל", כשהחלק החיצוני שנכתב על